Aunque el terreno de Almonte es muy grande y en algunas zonas hay microclimas, en general, la temperatura media de la localidad es de 17 °C, con unos veranos muy cálidos y unos inviernos suaves.
Las lluvias en Almonte no son muy abundantes, no superando los 700 mm anuales, sin embargo, son suficientes para mantener a Doñana húmeda.